Teses e Dissertações (BDTD USP - IFSC)
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Item Desenvolvimento e avaliação de modelos representativos para construção de aminoácidos e de estruturas de proteínas(2011-02-18) Silva, Aparecido Rodrigues daFoi desenvolvido um conjunto de peças plásticas que permitem a montagem e representação dos aminoácidos mais comuns, bem como a construção de estruturas protéicas. Durante e após o desenvolvimento o material foi submetido a várias etapas de avaliação por professores (do ensino básico e universitário), alunos de pós-graduação e de graduação. A primeira etapa foi o desenvolvimento dos modelos em ambiente computacional, seguida da prototipagem das peças. Após discussão com a comunidade científica (apresentados na XXXVI Reunião Anual da SBBq em 2007) as sugestões foram implementadas nos modelos computacionais. Quatro moldes para injeção termoplástica foram projetados, detalhados e construídos, sob nossa orientação. As peças representando as estruturas que compõe os aminoácidos e ligações foram produzidas em grande escala e iniciou-se o processo final de avaliação. As peças apresentaram boas relações geométricas com as fórmulas estruturais dos aminoácidos obtidas de bancos de dados e livros didáticos. As conexões Cα-amina e Cα-carboxila permitem verificar a liberdade de rotação característica das cadeias polipeptídicas e as possibilidades dos ângulos de torção Ψ e Φ, visualizando a restrição de rotação da ligação peptídica. Montando um conjunto de aminoácidos é possível construir uma cadeia polipeptídica e, através das ligações de hidrogênio, montar as estruturas secundárias principais (hélice-α e estruturas β). Duas avaliações preliminares foram realizadas e a avaliação final ocorreu em uma oficina de atividades com 256 professores das áreas de ciências da natureza da rede publica do Estado de SP. Os resultados da avaliação foram extremamente positivos, sendo importante destacar a quantidade e o teor dos comentários elogiosos ao potencial de utilização do material, notadamente, dos professores de biologia e química. O material poderá inclusive auxiliar no preenchimento de lacunas conceituais que existem na formação dos professores e que foram observadas durante as atividades de avaliação. Este conjunto de peças, organizado na forma de um kit: Construindo Estruturas de Aminoácidos e Proteínas, foi submetido à avaliação do MEC e certificado por este órgão, passando a integrar o Guia de Tecnologias Educacionais 2008.Item Estudo de propriedades ópticas não lineares de aminoácidos(2008-03-13) Rodrigues Junior, José JoatanNeste trabalho estudamos as propriedades ópticas não lineares de aminoácidos utilizando pulsos de laser com duração de femtossegundos. O índice de refração não linear (n2) da L-alanina, L-prolina, L-serina, L-treonina e L-arginina em solução aquosa foram determinados. Foi também estudada a influência do pH na magnitude de n2 dos aminoácidos em solução. Paralelamente, determinamos a dispersão de n2 em cristais de L-treonina nos três eixos principais, x, y e z. Os aminoácidos têm despertado grande interesse devido as suas boas propriedades ópticas de segunda ordem. Todavia, suas propriedades ópticas de terceira ordem ainda não haviam sido estabelecidas. Além disso, implementamos a técnica de espalhamento hiper-Rayleigh para determinar a primeira hiperpolarizabilidade (P) de moléculas orgânicas, onde uma mudança foi introduzida para permitir medidas mais rápidas e com melhor precisão. Foram encontrados os valores de P de algumas porfirinas e corantes orgânicos.Item Crescimento e caracterização óptica de cristais de L-treonina e L-lisina-HCL(2007-11-22) Rodrigues Junior, Jose JoatanNeste trabalho nós crescemos e caracterizamos oticamente cristais de L-treonina e L-lisina-HCl. Esses materiais pertencem a uma família de cristais orgânicos que tem demonstrado potencial para uso como dispositivos ópticos não lineares. Os cristais foram crescidos em solução aquosa pelos métodos de evaporação lenta do solvente e abaixamento controlado da temperatura. Realizamos medidas de óptica linear, índices de refração e a absorção óptica, e de óptica não linear, a geração de segundo harmônico (GSH). Essa nova classe de materiais não linear é de fácil crescimento e apresentam uma boa qualidade óptica e propriedades não lineares comparáveis as dos cristais de KDP.