O Instituto Nacional de Biotecnologia Estrutural e Química Medicinal em Doenças Infecciosas (INBEQMeDI) é uma iniciativa conjunta resultante de projetos de colaboração existentes focados no desenvolvimento de estudos estruturais e biológicos em alvos moleculares específicos em microorganismos associados com doenças tropicais negligenciadas, tendo como objetivo o desenvolvimento de novas drogas candidatas para o tratamento das doenças endêmicas leishmaniose, esquistossomose, doença de Chagas e malária. Esta proposta é encorajada pela nossa iniciativa bem sucedida do CEPID-FAPESP Centro de Biologia Molecular Estrutural, que pelos últimos 8 anos tem conduzido projetos inovadores em Biotecnologia estrutural e Química medicinal; incluindo desenvolvimento de patentes, transferência de tecnologia e disseminação da Ciência através de diversos programas dedicados a alunos e professores do ensino médio, bem como a população em geral. Outro fator fundamental para este proposta é o fato de termos sido recentemente selecionados pela Organização Mundial da Saúde, através de seu Programa de Pesquisas em Doenças Tropicais (TDR), como centro de referência mundial de Química medicinal em doença de Chagas. Esta proposta é liderada pelo Centro de Biologia Molecular Estrutural do Instituto de Física de São Carlos (IFSC), da Universidade de São Paulo (USP), o primeiro, mais tradicional e prestigioso grupo de cristalografia de proteínas e desenho de drogas baseado em estrutura. Em adição a este grupo principal, nós propomos como grupos associados: 1) o laboratório de produtos naturais e síntese orgânica do Departamento de Química, Universidade Federal de São Carlos (DQ-UFSCar); quatro outros grupos de pesquisa de Parasitologia e Química medicinal da Universidade de São Paulo; 2) o laboratório para o estudo das bases moleculares de transdução de sinal do parasita da malária, do Departamento de Fisiologia, Instituto de Biociência; 3) o laboratório do Dr. A. Silber do Departamento de Parasitologia, Instituto de Ciências Biomédicas (ICB-USP); 4) o laboratório da Prof. Angela K. Cruz, do Departamento de Biologia Celular e Molecular de Agentes Patogênicos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP). Adicionalmente, o INBEQMeDI inclui grupos de dois jovens pesquisadores como laboratórios associados, Dr. Jorge Iulek, um cristalógrafo de proteínas estabelecido na Universidade Estadual de Ponta Grossa e a Dra. Juliana Lopes Rangel Fietto, uma bióloga molecular trabalhando no Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular da Universidade Federal de Viçosa. O Principal objetivo deste centro é realizar tanto pesquisa aplicada como básica, bem como desenvolvimento tecnológico e educação em Ciência para doenças infecciosas tropicais negligenciadas, que se fundamente no planejamento molecular baseado em estrutura, especificamente no desenho racional de drogas e vacinas baseado em estruturas moleculares. A fim de alcançar estes objetivos, o INBEQMeDI promoverá uma abordagem multidisciplinar, incluindo a utilização de técnicas de Biologia molecular, Bioquímica, Biologia estrutural (cristalografia de proteínas, NMR multidimensional, modelagem molecular e bioinformática), Química medicinal baseada tanto em produtos químicos sintéticos quanto naturais, Imunologia molecular, Biologia celular e Farmacologia. Os projetos incorporados pelo INBEQMeDI foram selecionados com base no seu potencial como alvos para quimioterapia em doenças tropicais. Integração e colaboração com o setor privado é sempre buscado, em particular com companhias farmacêuticas e de biotecnologia e institutos de pesquisa do setor de saúde.