Universidade de São PauloTravieso, Gonzalo2016-09-212016-09-212007-04-20http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/54/54132/tde-18042007-143803/http://repositorio.ifsc.usp.br/handle/RIIFSC/6923Neste trabalho, propomos um método de paralelização de simulações de dinâmica molecular para execução em máquinas de memória distribuída, trabalhando sob passagem de mensagens. Nos limitamos à análise de implementação de sistemas com ensemble microcanônico de partículas de Lennard-Jones, desenvolvendo no entanto um sistema que pode ser expandido para incluir outras características. Mostramos que o sistema apresenta bom desempenho com relação à paralelização, representando uma alternativa viável para a simulação de sistemas com muitas partículas.A method for parallelization of molecular dynamics simulations in distributed memory machines operating under the message-passing paradigm is proposed. Even though the analysis and implementation presented in this work were primarily restricted to the system model known as microcanonical emsemble of Lennard--Jones particles. the obtained system can easily be adapted for inclusion of other characteristics. It is shown t,hat. the developed system is well suited for parallelization, resulting in a feasible a1ternative for simulation of many-particle systems.application/pdfDinâmica molecularProcessamento paraleloProcessos seqüênciais comunicantesCommunicating sequential processesMolecular dynamicsParallel processingTese de DoutoradoTravieso, Gonzalo10.11606/T.54.1993.tde-18042007-143803