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Item Estudo das relações quantitativas entre a estrutura e a atividade de inibidores da purina nucleosídeo fosfarilase de Schistosoma mansoni da gliceraldeido-3-fosfato desidrogenase glicossomal de tryponasoma [... ](2017-05-11) Andricopulo, Adriano DefiniOs objetivos principais deste projeto são os estudos das relações quantitativas entre a estrutura e a atividade de inibidores da purina nucleosídeo fosforilase de Schistosoma mansoni, da gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase glicossomal de Trypanosoma cruzi e da adenina-fosforribosil-transferase de leishmania tarentolae, compostos candidatos a protótipos de novos fármacos no tratamento quimioterápico da esquistossomose, doença de Chagas e leishmaniose, respectivamente. Para a realização de nossos objetivos, planeja-se a criação de amplos conjuntos padrões de dados para inibidores das enzimas alvo. Estes conjuntos, contendo os dados de estrutura e atividade inibitória correspondentes, organizados e classificados, serão a base científica para os estudos de modelagem molecular e o desenvolvimento de modelos de QSAR/QSAR 3D, empregando diferentes abordagens e metodologias de QSAR. Os modelos preditivos de QSAR/QSAR 3D, uma vez criados, serão úteis para o planejamento e desenho estrutural de novas moléculas que possuam propriedades farmacoterapêuticas otimizadas, capazes de representarem novas entidades químicas, candidatas a protótipos de novos fármacos na quimioterapia segura das doenças infecto-parasitárias de interesse neste projeto.Item Estrutura cristalográfica da enzima hipoxantina-guanina fosforibosiltransferase (HGPRT) de Leishmania tarentolae complexada com GMP.(2008-10-08) Monzani, Paulo SérgioO presente trabalho teve como objetivos a clonagem, expressão e purificação da proteína HGPRT de Leishimania tarentolae, para a caracterização e cristalização dessa enzima, a fim do seu estudo estrutural e funcional. O gene da HGPRT foi amplificado a partir de uma biblioteca genômica de Leishmania tarentolae da cepa UC Lambda ZAP Express BamHI-Sal3A I. Esse gene foi clonado no vetor de expressão pET29a(+) e usado na transformação da bactéria Escherichia coli BL21 (DE3). Esse sistema de expressão apresentou uma superexpressão da proteína recombinante, que foi purificada em cromatografia de forma iônica, com o uso da coluna de troca anônica POROS 20HQ. A proteína purificada foi utilizada para sua caracterização, como a determinação das constantes cinéticas (Km, Vmax e Kcat) para os diferentes substratos. A proteína foi encontrada como dímero em solução e o pI de aproximadamente 8,2. Além disso, essa proteína foi utilizada nos ensaios de cristalização pelo método de difusão de vapor em gotas suspensas. Os cristais obtidos foram utilizados nos testes da difração de raios-X sendo coletado um conjunto de dados no Laboratório Nacional de Luz Síncroton. Os dados de difração de raios-X foram processados com o uso do pacote de programa HKL. A resolução da estrutura cristalográfica foi obtida pelo método de substituição molecular através do programa AmoRe. Para o refinamento da estrutura foram utilizados os programas de refinamento automático CNS e REFMAC, e a manipulação na estação gráfica foi realizada através do programa O. A estrutura da HGPRT foi resolvida a 2,1 Å de resolução com os fatores de concordância Rwork e Rfree finais de 17,34 e 21,53%, respectivamente.Item Parceria em busca de novos medicamentos(Jornal da USP, p. 8, 2015-07-13) Sintra, Rui; Sintra, Rui; jornalistaO Centro de Pesquisa e Inovação em Biodiversidade e Fármacos, Cibfar/IFSC, participa do projeto International Cooperative Biodiversity Groups, ICBG, criado pelo National Institutes of Health (NIH) dos Estados Unidos. O objetivo da iniciativa é encontrar compostos naturais com potenciais aplicações terapêuticas contra diversas doenças, incluindo malária, doença de Chagas e leishmaniose. Entre as atividades do ICBG, o IFSC recebeu recentemente, a visita do Prof. Jon Clardy, da Universidade de Harvard, nos Estados Unidos e da Dra. Flora Katz, diretora da Division International Training and Research, do NIH, que participaram de diversas reuniões com docentes e pesquisadores membros do Cibfar, entre eles o docente e pesquisador do Cibfar, Prof. Dr. Adriano Andricopulo, para quem a participação do instituto nessa rede de cooperação é de suma importância, uma vez que a unidade tem grande interesse por pesquisas que visam ao desenvolvimento de fármacos para o combate de doenças como Chagas e leishmaniose.Item Cruzadinha(2015-06-18) Ferreira, Ana Clara Kandratavicius; Silva, Marília Faustino da; Souza, Claudinei Caetano de; Costa, Gislaine Gomes da; Trevilato, Rudison Beltramini; Bossolan, Nelma Regina Segnini; Beltramini, Leila MariaO jogo possui um conjunto de dicas que correspondem às palavras a serem encaixadas na cruzadinha. O jogador poderá clicar no símbolo “+” que está localizado ao lado da dica para obter mais informações sobre a palavra a ser preenchida na cruzadinha. Para cada doença (Doença de Chagas, Malária, Esquistossomose, Leptospirose e Leishmaniose) haverá dois níveis de dificuldade. Cruzadinhas está integrado com rede social (Facebook).Item Liga dados(EIC - IFSC, 2015-06-18) Ferreira, Ana Clara Kandratavicius; Faustino, Marília da Silva; Souza, Claudinei Caetano; Costa, Gislaine Gomes; Bossolan, Nelma Regina Segnini; Beltramini, Leila MariaAplicativo desenvolvido para web onde o usuário deve relacionar as imagens com as informações nos campos correspondentes. Ao verificar ele recebe o feedback de suas ações. Liga Dados possui integração com rede social (Facebook) e trabalha os temas: Doença de Chagas, Malária, Esquistossomose e Leptospirose e Leishmaniose.