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Item Estudos estruturais e correlações com a função biológica entre formas nativas, desnaturada e reenoveladas, investigadas por métodos espectroscópicos, proteínas de interesse biotecnológico(2017-05-16) Beltramini, Leila MariaEntender como e por que as proteínas adotam um enovelamento específico, entre todos os possíveis, e só neste têm atividade biológica é um dos problemas mais interessantes da natureza. O conhecimento da estrutura tridimensional de um grande número de proteínas mostra que estas podem adotar o mesmo enovelamento com seqüências muito diferentes. Isso implica que, desenvolvendo-se um método para se enovelar uma proteína de certa família, o enovelamento dos demais membros desta família estaria determinado. Nos estudos sobre mecanismos de enovelamento reenovelamento de proteínas são utilizados métodos bioquímicos, biofísicos e teóricos, sendo que "in vitro", o estado inicial deste estudo é a proteína desnaturada e a recuperação de sua atividade biológica deve ser a prova de seu reenovelamento. Em linhas gerais a proteína desnaturada se colapsa numa forma mais compacta, não polar, e forma estruturas secundárias com pouca estabilidade termodinâmica, a seguir o desenvolvimento da estrutura secundária se completaria, ao mesmo tempo em que ocorreria a formação da estrutura terciária pelas interações não covalentes, originando a forma final da estrutura da proteína. Nosso grupo vem desenvolvendo estudos sobre a estabilidade estrutural de proteínas nativas e recombinantes, que sejam de interesse biotecnológico, e quando possível, o processo de reenovelamento é acompanhado por métodos espectroscópicos e recuperação de sua atividade biológica. No presente projeto serão estudadas representantes de duas classes de proteínas: lectinas e enzimas recombinantes. Lectnas são proteínas ligantes de carboidratos e de glicoconjugados e estão envolvidas numa grande diversidade de fenômenos. Lectinas de origem vegetal, estão envolvidas em fenômenos de defesa destes, como também funcionam como proteínas de reserva. Elas participam tanto "in vivo como in vitro", de fenômenos de reconhecimento de carboidratos na superfície celular, bem como no esclarecimento da estrutura destes. Também são empregadas para purificação de glicoproteínas como IgG, receptores de hormônios, etc, o que faz delas ferramentas muito empregadas em biotecnologia. Lectinas de Moráceas (gênero Artocarpus): Frutalina e KM+ e lectinas de Cesalpinoídea, serão os alvos de nossos estudos. A expressão de algumas enzimas recombinantes, em particular de protozoários, que são vistas como potenciais alvos para o desenvolvimento de drogas inibidoras de suas funções, também vem sendo estudadas por nós. No presente projeto será abordado o estudo de uma enzima recombinante, de Leishmania tarentolae, a Adenina Fosforibosil Transferase (APRT) que tem a capacidade metabólica de absorver do meio circundante a adenina e converte-la a nucleotídeo pela chamada via de "recuperação" de purinas. Os tripanossomatídeos, em geral, utilizam a via de recuperação, ao invés da via Biosintética "de novo", como ocorre nos animais superiores. O protozoário Leishmania tarentolae é um organismo não patogênico, altamente relacionado em termos genéticos e bioquímicos às espécies de Leishmania parasitas. Este fato faz da L. tarentolae, e em particular da APRT, um interessante objeto de estudo já que esta enzima parece ser importante, se não indispensável, para a recuperação de purinas na forma infestante do parasita. Estes estudos terão como objetivo a caracterização estrutural, bem como o mecanismo de desnaturação e renaturação das proteínas KM+, Frutalina, lectinas de Caesalpinea e da enzima APRT. Para isto serão aliados métodos cromatográficos de alta resolução, métodos espectroscópicos (dicroísmo circular, fluorescência, ressonância paramagnética eletrônica e infra-vermelho) e métodos cristalográficos na expectativa de que o conhecimento das estruturas e dos mecanismos moleculares envolvidos nos fenômenos biológicos em que estas proteínas participam, propiciarão o desenvolvimento de drogas planejadas que interfiram com a atividade das mesmas.Item Caracterização físico-química e estrutural, correlações entre estrutura/função de compostos biologicamente ativos extraídos de sementes de árvores tropicais(2017-05-16) Beltramini, Leila MariaA purificação, caracterização físico-química-biológica e estrutural de substâncias bioativas ligadas às lectinas ou que apresentem atividade anticoagulante oriundas de sementes de vegetais, constituem nosso objeto de estudo. Estas substâncias estão presentes em quantidades razoáveis nas sementes o que facilita sua purificação com um rendimento que garante o sucesso dos estudos estruturais. A utilização de métodos espectroscópicos como dicroísmo circular, fluorimetria, ressonância paramagnética eletrônica, ressonância magnética nuclear, difração de raios X, aliados a metodologias modernas na área de cromatografia para separação de fragmentos e/ou cadeias das proteínas em estudo permitirão melhor compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos nos fenômenos biológicos. Estes por sua vez poderão elucidar o significado e a importância destes compostos para o próprio vegetal, bem como facilitar o desenv. de drogas que possam interferir em fenômenos fisiopatológicos em animais (aderência bacteriana, reação inflamatória, migração celular, células tumorais) e/ou nos vegetais (proteção ao ataque de fungos, bact. e protozoários).Item Modelo tridimensional para representar molécula ou parte de molécula de ácido nucléico e kit(República Federativa do Brasil - Ministério do Desenvolvimento, Indústria e do Comércio Exterior - Instituto Nacional da Propriedade Industrial, 2005-03-15) Beltramini, Leila Maria; Araujo, Ana Paula Ulian de; Abel, Luciano Douglas dos SantosA presente invenção refere-se a componentes modulares para serem usados na construção de modelos moleculares que representam a estrutura tridimensional de moléculas orgânicas e kits compostos pelos mesmos. Mais especificamente, a invenção revela componentes que permitem a construção de um modelo da molécula de DNA (ácido desoxirribonucléico) e, a partir dele, a visualização dos processos de duplicação e transcrição em uma molécula de RNA (ácido ribonucléico), com compreensão, inclusive, da síntese protéica.Item Unidades representativas de aminoácidos e kit educacional compreendendo as mesmas(República Federativa do Brasil - Ministério do Desenvolvimento, Indústria e do Comércio Exterior - Instituto Nacional da Propriedade Industrial, 2010-01-12) Silva, Aparecido Rodrigues da; Beltramini, Leila MariaA presente invenção compreende um conjunto de unidades representativas para os 20 aminoácidos principais. Adicionalmente, a presente invenção compreende unidades representativas do carbono alfa, do grupo amina, do grupo carboxila, do hidrogênio e elementos de conexão (ligações peptídicas, pontes de hidrogênio e ligações dissulfeto). Adicionaímente, a presente invenção compreende a representação da polaridade, eletronegatividade e hidrofilia das cadeias laterais desses aminoácidos. Os modelos possuem dimensões e encaixes adequados à montagem das estruturas de cada aminoácido e pinos de conexão para a montagem de cadeias de aminoácidos, ou seja, permitem representar estruturas primárias, secundárias, terciárias e quaternárias de proteínas. A presente invenção se situa no campo da biologia e educação.Item Quiz da galinha perguntadora(2015-07-06) Silva, Marília Faustino da; Souza, Claudinei Caetano de; Costa, Gislaine Gomes da; Bossolan, Nelma Regina Segnini; Beltramini, Leila MariaAplicação tipo quiz, que apresenta de forma lúdica uma galinha que faz perguntas sobre a Doença de Chagas. O usuário inicia o jogo com a pontuação máxima e a cada erro é descontado um pequeno percentual em cima do escore total, a fim de estimular o usuário dando um feedback do seu grau de conhecimento sobre a doença.Item Sintetizando proteínas(2015-07-06) Souza, Claudinei Caetano de; Diogo, Rodrigo Claudino; Costa, Gislaine Gomes da; Bossolan, Nelma Regina Segnini; Beltramini, Leila MariaVersão online e interativa do jogo de tabuleiro “Sintetizando proteínas”, idealizado pela equipe do EIC. Nesta atividade você irá seguir as etapas que ocorrem dentro da célula, de organismos eucariotos, para que uma proteína possa ser sintetizada. Deste modo, a partir de um gene você conseguirá sintetizar uma proteína.Item Disco de aminoácidos(2015-07-06) Souza, Claudinei Caetano de; Diogo, Rodrigo Claudino; Beltramini, Leila MariaVersão online interativa do Disco de Aminoácidos do CBME, com visualização das moléculas dos aminoácidos com recursos tridimensionais. Na visualização 3D é possível interagir de modo a permitir, por exemplo, rotação das moléculas, exibição de pontes de hidrogênio e superfície de Van Der Waals.Item Jogo da memória(2015-07-06) Silva, Marília Faustino da; Souza, Claudinei Caetano de; Costa, Gislaine Gomes da; Bossolan, Nelma Regina Segnini; Beltramini, Leila MariaO jogo da memória da Doença de Chagas é composto por três fases com grau de dificuldade crescente. Na primeira fase o jogador deverá associar uma imagem com sua semelhante. Para jogar a segunda fase uma imagem deverá ser associada com seu nome. Na terceira, e mais desafiante fase, uma imagem deverá ser associada ao seu nome e seu significado.Item Série parasitas: Doenças de Chagas(2015-07-06) Souza, Claudinei Caetano de; Costa, Gislaine Gomes da; Silva, Marília Faustino da; Coser, Thiago; Beltramini, Leila Maria; Bossolan, Nelma Regina SegniniSoftware interativo sobre a Doença de Chagas foi desenvolvido para computador, no qual o usuário navega em primeira pessoa através de um cenário contendo duas casas: uma simbolizando um ambiente típico de onde se pode contrair a Doença de Chagas, casa de pau a pique com barbeiros. E uma segunda casa, simbolizando um laboratório de pesquisa. A navegação completa, percorrendo todos os objetos clicáveis que os ambientes possuem, proporciona ao usuário todas as informações básicas sobre a Doença de Chagas, incluindo estudos desenvolvidos por pesquisadores do Espaço Interativo de Ciências, na área de desenvolvimento de novos fármacos.Item Série parasitas: Malária(2015-07-06) Souza, Claudinei Caetano de; Costa, Gislaine Gomes da; Foersts, Andreas Munte; Fernandes, Yvan; Martins, Julia Mara; Silva, Marília Faustino da; Trevilato, Rudison Beltramini; Bossolan, Nelma Regina Segnini; Beltramini, Leila MariaO segundo software da Série Parasitas apresenta um cenário inspirado em um ambiente ribeirinho do Estado do Amazonas, cercado por vegetação típica. Nele há personagens e objetos clicáveis aos quais estão associados vídeos de curta duração, locuções, imagens com informações sobre a Malária.
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