A presente invenção se refere a um microendoscópio de refletância e fluorescência portátil acoplável a smartphones ou similares, apresentando a possibilidade de intercambiar duas configurações para o diagnóstico da morfologia celular utilizando um marcador, tanto in situ, através de um feixe de fibras ópticas, quanto em esfregaço celular ou fluidos biológicos, através de um porta amostras. O referido microendoscópio é principalmente utilizado para o diagnóstico clínico de tecidos, esfregaço celular (citologia), análise de fluidos biológicos, ou de amostras teciduais em lâminas de microscopia.